进入新时期，水利科技在水利发展中的重要性越来越显著。“十五”期间，水利科技紧密围绕水利建设主战场，大力开展科学研究、技术开发和推广转化，不断用高新技术改造水利传统行业，以科技进步推动水利现代化，为可持续发展水利提供了强有力的科技支撑。水利科技对行业发展的贡献率不断提高。

 
　　制定和发布了《水利科技发展规划（2001－2010）》，开展水利科技发展战略研究，确定了我国水利科技的发展方向、重点领域及关键技术，从而为今后一个时期开展重大水利科技问题研究提供了重要依据。制定出台了《关于加强水利科技创新的若干意见》，从政策层面统筹解决科技投入不足、创新活力不够等问题。
　　科技进步要依靠创新。“十五”期间，新增了水利科技成果重点推广计划、现代水利科技创新专项计划等，水利科技计划体系逐步健全。据初步统计，共组织国家、部级各类科技项目500余项，经费超过5亿元。截至目前，已取得创新成果200余项，近30项达到国际领先水平，100多项达到国际先进水平，近30项水利水电类科技成果获得国家科技进步奖。水利科技对行业发展的贡献率达到40％左右。通过持续不断的科技创新，目前我国水利科技的总体水平已基本上达到了国际先进水平，一些领域已处于国际领先地位。

　　科技推广转化力度加大，大批先进、实用技术和高新技术在水利行业中得到广泛应用。科技管理日益规范化、系统化。科技已成为解决流域、区域重大水问题的关键因素。