发生洪涝灾害后，饮用水源受到严重污染，使水中含有大量的病原微生物。对直接以河、湖水为饮用水源的必须经过净化消毒处理。
常用的净化剂有：明矾、聚合氯化铝、硫酸铝等。
使用方法是：用桶盛水、按每桶(约25l水)用量：聚合氯化铝0.75～1.5g或明矾2.5～3.75g或硫酸铝1.25～2.5g的比例加入药剂，用干净的林棒搅和。使之充分溶解，然后静置澄清1小时左右，再用无毒的吸水管将清液吸入水缸内备用。
常用的消毒剂有：漂白精片、一片净、优氯净(二氯异氰尿酸钠)等含氯消毒剂。对新开挖的水井应随时加氯消毒，用量以漂白粉类每升3～5毫克、优氯净每m3水2～3g为宜；被洪水淹没的旧井，应掏去淤泥污物，进行加量消毒后再使用。方法是：公用水井每日早、中、晚各投药一次，家庭井每日投药1次，投药量按每吨水加漂白精片10片的用量计算出总需药量后，先将药片碾碎用冷水溶解，然后再倒入水井中，再用吊桶将井水上下搅动数次，30分钟后即可取用。
