如何从省水情出发，实行最严格的水资源管理，对水资源进行合理开发、综合治理、优化配置、全面节约、有效保护，对此，云南出台了一系列制度，全面提高水资源管理能力和水平，着力提高水资源利用效率和效益，以水资源的可持续利用支撑经济社会的可持续发展。
建立用水总量控制制度。全省继续开展云南省取水许可总量控制指标方案编制工作，目前正抓紧开展流域委分解到全省的水资源用水总量控制指标进行平衡协调。召开了2010年度全省水资源公报重要指标复核协调会议，为今后确定2015年、2020年、2030年各州市用水总量控制指标打下了坚实基础。开展地下水开发利用红线管理。开展了全省“地下水开发利用红线管理”编制工作。完成了《云南省地下水禁采区、限采区划定报告》复核工作。
建立用水效率控制制度。积极谋划“十二五”节水型社会建设，全面开展节水型社会建设“十二五”规划编制工作。继续推进曲靖、玉溪试点建设进度及玉溪市节水型社会建设中期评估工作。玉溪市节水型社会建设试点顺利通过水利部珠江水利委员会组织开展的中期评估。昆明市被住建部命名为第五批（2011年度）国家节水型城市。加强节水监督管理，对《云南省大中型灌区用水效率考核方案、考核办法》和《云南省规模以上企业用水效率考核方案、考核办法》进行跟踪调研，进一步修改完善区域及行业用水考核体系。根据《云南省关于加快实施兴水强滇战略的决定》，对节水型社会建设取得初步成效的昆明、曲靖、玉溪等地区进行先行试点考核，通过对用水单位的组织、管理、计量、设施、指标等五项内容进行严格考核、评定，逐步建立全省用水效率考核监督评价体系。加强重点用水单位节水监督管理，选择昆明市为试点开展重点缺水区域和重点节水行业节水工作检查和考核，开展重点企业水平衡测试工作；启动重点行业用水效率监控评价；开展昆明市北美职业学院再生水利用示范工程和黑龙潭公园雨水收集利用示范工程；选择曲靖市开展中型灌区节水指标考核试点工作，以点带面，积累经验，逐步建立用水效率和效益评价与考核制度。
建立水功能区限制纳污制度。强化水功能区监督管理，配合珠江水利委员会和长江水利委员会完成了全省与西藏、四川、贵州、广西四省（区）省界（缓冲区）水质监测断面复核、认定。编制完成了《云南省主要水功能区水资源质量监测评价工作方案》，确定了全省水功能区2015年保护目标、初步拟定了达标考核的方案、明确了水功能区监测评价的指标体系、监测断面、监测频次和评价方法、信息发布方式及发布范围等内容。完成了《云南省水功能区划》所有水功能区纳污能力核定。启动了文山州清水河、玉溪市抚仙湖的河湖健康评估试点工作。积极推进饮用水水源地保护，编制完成了《云南省主要城市重要集中式饮用水水源地水资源质量监测评价工作方案》，初步拟定了各地饮用水水源地达标考核方案。全省已有10个水源地被水利部纳入了全国重要饮用水水源地名录中。配合长江委完成了《长江流域饮用水水源地保护规划（2011—2015年）》的编制。启动了丽江水资源生态修复与保护规划的前期准备工作。
